Ein Auftrag bezeichnet im Warehouse-Management gewöhnlich einen Lieferauftrag, der sich in weitere Teilaufträge untergliedern kann: Den Kommissionierauftrag, den Produktionsauftrag, den Versandauftrag, und den Transportauftrag. Weiterhin gibt es auch den Umlagerungsauftrag, den Einlagerungsauftrag, den Reparaturauftrag, den Retourenauftrag und andere. Angekündigt wird ein Lieferauftrag gewöhnlich durch die Avise, die durch das Host-System (ERP) an die WMS weitergegeben wird oder direkt vom Versanddienstleister an die WMS gesendet wird.